پژوهشکده اقتصاد دانشگاه تربیت مدرس با هدف اشاعه و گسترش تحقیقات بنیادی، کاربردی و توسعه ای در حوزه دانش اقتصاد و بر اساس نیاز جامعه در دی ماه سال 1368 فعالیت خود را در قالب مؤسسه تحقیقات اقتصادی آغاز نمود و پس از یک دهه فعالیت در سال 1377 با اخذ موافقت قطعی از وزارت علوم، تحقیقات و فناوری به پژوهشکده اقتصاد ارتقا یافت.

پژوهشكده فناوري اطلاعات (وابسته به دانشگاه تربيت مدرس)،نهادي علمي- پژوهشي است كه در زمستان 1380 با اهداف ساماندهي، تعميق و نهادينه كردن توسعة وجوه مختلف فناوري اطلاعات به منظور رفع نيازهاي ملي و گسترش مرزهاي دانش و همچنين بسترسازي مناسب علمي-فرهنگي براي بهره‌گيري از امكانات فناوري اطلاعات در كشور تاسیس شد.

با توجه به اهمیت و ضرورت پرداختن به مسائل آب کشور از جنبه های مختلف و وجود توان بالا در این زمینه در دانشگاه تربیت مدرس لزوم ایجاد یک تشکل علمی ـ تحقیقاتی و بین رشته ای در زمینه مهندسی آب در این دانشگاه آشکار شد.