دانشگاه تربيت مدرس در سال 1363 تاسيس شد. هدف اصلي ايجاد اين دانشگاه، اين بود تا شرايط و فرصتي را ايجاد كند تا اعضاء هيئت علمي ساير دانشگاهها بتوانند مهارتهاي آموزشي و پژوهشي خود را افزايش دهند. بعلاوه اينكه اين دانشگاه جامع تحصيلات تكميلي براي اولين بار توانست با برنامه ريزيهاي آموزشي و ايجاد دوره ها نيروهاي متخصص ساير دانشگاهها را در كشور تامين نمايد.از زمان تاسيس تا كنون تعداد قابل توجهي از جوانان متعهد و متخصص از دانشگاه تربيت مدرس فارغ التحصيل شدند و اكنون بعنوان عضو هيئت علمي در ساير دانشگاهها در كشور مشغول خدمت هستند.
دانشكده علوم پزشكي تربيت مدرس نيز بطور رسمي در سال 1364 با پذيرش 65 دانشجوي كارشناسي ارشد در رشته هاي علوم پايه پزشكي كار خود را شروع كرد. سپس در سال 1367 اولين دوره هاي دكتري تخصصي (Ph.D) شامل 26 دانشجوي علاقه مند و مشتاق در 5 گروه آمار حياتي، انگل شناسي پزشكي ، علوم تشريح و باكتري شناسي پزشكي و بيوشيمي باليني پذيرش شدند.
پس از 25 سال خدمت تعداد فارغ التحصيلان دانشكده علوم پزشكي به 2360 رسيده است كه 2000 نفر آنها كارشناسي ارشد و 360 نفر آنها موفق به اخذ مدرك دكتري شدند. در حال حاضر 79 نفر عضو هيئت علمي تمام وقت شامل 20 نفر آنها استاد تمام در فعاليتهاي آموزشي – پژوهشي در 18 گروه فعاليت دارند. براي حفظ و رعايت استانداردها و كيفيت برنامه هاي درسي تعداد دانشجوياني كه هر ساله در گروههاي مختلف پذيرش مي شوند حدود 150 نفر است.
در حال حاضر جمعاٌ حدود 500 نفر دانشجو مشغول گذراندن دوره هاي آموزشي و انجام پايان نامه هاي خود هستند. علاوه بر تسهيلات عمومي نظير آزمايشگاه حيوانات، كتابخانه و مركز كامپيوتر، بيش از 70 آزمايشگاه تحقيقاتي مجهز وجود دارد كه به محققين خدمات ارائه مي نمايد.
بر اساس آمارها توليدات علمي دانشكده علوم پزشكي اميدوار كننده است. براي نمونه در سال 1386 تعداد مقالات چاپ شده توسط 79 نفر عضو هيئت علمي در مجلات علمي – پژوهشي معتبر 366 مورد بوده است كه 230 مورد آن در پايگاههاي بين المللي نمايه شده است. گروههاي آموزشي اين دانشكده همكاري بسيار نزديكي با بيمارستانها و مراكز پژوهشي و دانشگاههاي مختلف برقرار كرده است تا برنامه هاي كارورزي و نمونه گيري برا براي انجام تحقيقات تسهيل كند.

 در اينجا اولويت پژوهشي دانشكده براي هر گونه همكاري ذكر مي شود:

• شناسايي و تعيين ويژگي سلولهاي بنيادي از منابع مختلف
• سرطان و فرايند سرطانزايي
•  سيستمها و مدلهاي آموزش بهداشت
• نروفيزيولوژي و بيولوژي مولكولي
• شناسايي و مديريت عوامل محيطي و شغلي
  

روسای دانشکده علوم پزشکی-دانشگاه تربیت مدرس:

• دکتر محمد تقی خانی (سه دوره): 1362-1364 ، 1367-1369 ، 1373-1375
• دکتر (مرحوم) سید احمد حسینی1364-1367
• دکتر احمد حسینی1369-1373
• دکتر سقراط فقیه زاده1374-1378
• دکتر محمد جواد رسائی1378-1384
• دکتر عبدالامیر علامه 1384 – ادامه دارد