گروه باکتری شناسی در سال 1362 با  پذیرش دانشجوی کارشناسی ارشد در رشته باکتری شناسی با هدف تربیت اعضاء هیات علمی ، محققان و متخصصان برای مراکز آموزشی و پژوهشی کشور شروع به کار کرد و سپس در سال 1367 برای دوره دکتری تخصصی دانشجو پذیرفت . این گروه با داشتن 4 عضو هیات علمی متشکل از یک استاد و 2 دانشیارو یک استادیار به ترتیب بالغ بر 128 فارغ التحصیل در مقطع کارشناسی ارشد و 36 فارغ التحصیل در رشته دکتری تخصصی داشته است . دانش آموخته گان این گروه علاوه بر داشتن توانایی های علمی و تخصصی از قابلیت های ویژه ای نیز برخوردار می باشند به طوری که تعداد قابل توجهی از فارغ التحصیلان به عنوان اعضای هیات علمی در دانشگاهها و مراکز پژوهشی کشور فعالیت می کنند .سایر دانش آموختگان نیز در آزمایشگاههای تشخیص بالینی در بیمارستانها و مراکز درمانی مشغول خدمت می باشند . در حال حاضر 6 دانشجوی کارشناسی ارشد و 26 دانشجوی دکتری در این گروه مشغول به تحصیل می باشند.